Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC241377.2-202ENST00000636462 997 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR2G6-201ENST00000343414 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC008734.1-201ENST00000594006 537 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms