Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ACADSBP45954 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms