Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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