Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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