Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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CNTN3Q9P232 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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CNTN3Q9P232 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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