Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TDRD12Q587J7 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms