Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USF2Q15853 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USF2Q15853 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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