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| CHD4 | Q14839 | AL512380.1-202 | ENST00000447728 | 543 nt | TSL 5 BASIC | 7.28 | □□□□□ -1.24 | | |
| CHD4 | Q14839 | NUTF2P7-201 | ENST00000453086 | 375 nt | BASIC | 7.28 | □□□□□ -1.24 | | |
| CHD4 | Q14839 | RPL17P2-201 | ENST00000491913 | 451 nt | BASIC | 7.28 | □□□□□ -1.24 | | |
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| CHD4 | Q14839 | LINC02327-205 | ENST00000550990 | 472 nt | TSL 3 BASIC | 7.28 | □□□□□ -1.24 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC074050.3-201 | ENST00000569175 | 441 nt | TSL 4 BASIC | 7.28 | □□□□□ -1.24 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC015912.1-201 | ENST00000574826 | 538 nt | TSL 3 BASIC | 7.28 | □□□□□ -1.24 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL163952.1-201 | ENST00000612704 | 916 nt | TSL 5 BASIC | 7.28 | □□□□□ -1.24 | | |
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| CHD4 | Q14839 | PTPRT-209 | ENST00000612229 | 11285 nt | TSL 5 BASIC | 7.28 | □□□□□ -1.24 | | |
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| CHD4 | Q14839 | ZNF92-201 | ENST00000328747 | 3210 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 7.27 | □□□□□ -1.24 | | |
| CHD4 | Q14839 | GON4L-204 | ENST00000437809 | 7713 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 7.27 | □□□□□ -1.24 | | |
| CHD4 | Q14839 | MCFD2-202 | ENST00000409105 | 4210 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 7.27 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | CNTN5-202 | ENST00000418526 | 3679 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 7.27 | □□□□□ -1.25 | | |
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| CHD4 | Q14839 | NOSTRIN-202 | ENST00000397206 | 1446 nt | TSL 1 (best) BASIC | 7.27 | □□□□□ -1.25 | | |
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| CHD4 | Q14839 | AC006213.6-201 | ENST00000623722 | 4179 nt | BASIC | 7.27 | □□□□□ -1.25 | | |
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| CHD4 | Q14839 | PAQR5-201 | ENST00000340965 | 4943 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.27 | □□□□□ -1.25 | | |
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| CHD4 | Q14839 | ZNF248-201 | ENST00000357328 | 4795 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 7.27 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | GFPT1-202 | ENST00000361060 | 8632 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.27 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | MYBPC1-209 | ENST00000547509 | 3749 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 7.27 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC009804.1-201 | ENST00000400949 | 179 nt | BASIC | 7.27 | □□□□□ -1.25 | | |
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| CHD4 | Q14839 | CACNA1E-209 | ENST00000621551 | 14886 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 7.27 | □□□□□ -1.25 | | |
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| CHD4 | Q14839 | GALK2-201 | ENST00000327171 | 5299 nt | TSL 1 (best) BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | KAT6A-202 | ENST00000396930 | 9285 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
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| CHD4 | Q14839 | IARS-202 | ENST00000375643 | 4656 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | EYA4-206 | ENST00000431403 | 2154 nt | TSL 5 BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL359091.1-201 | ENST00000449048 | 1734 nt | BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC091046.3-201 | ENST00000631455 | 1574 nt | BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
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| CHD4 | Q14839 | TAS2R16-201 | ENST00000249284 | 997 nt | APPRIS P1 BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNU1-32P-201 | ENST00000363937 | 159 nt | BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | MANSC4-201 | ENST00000381273 | 1023 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | TRBV23-1-201 | ENST00000390396 | 347 nt | APPRIS P1 BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNASE9-202 | ENST00000404716 | 1247 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | P2RY10P2-201 | ENST00000416730 | 913 nt | BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL159174.1-202 | ENST00000425588 | 442 nt | TSL 3 BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL138878.2-201 | ENST00000440581 | 1241 nt | BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL035090.1-201 | ENST00000454835 | 332 nt | BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | PDCL3P4-201 | ENST00000489621 | 720 nt | BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | FTH1P8-201 | ENST00000498161 | 514 nt | BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | OR5AZ1P-201 | ENST00000527448 | 943 nt | BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL133166.1-205 | ENST00000548306 | 569 nt | TSL 4 BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | RNASE9-205 | ENST00000553706 | 1172 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC011840.5-201 | ENST00000582125 | 771 nt | BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | PARP4P2-201 | ENST00000446672 | 3326 nt | BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | APOL4-203 | ENST00000352371 | 3227 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | LINC01722-201 | ENST00000456265 | 3033 nt | TSL 1 (best) BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | CEACAM5-202 | ENST00000398599 | 2451 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | CDK19-203 | ENST00000413605 | 6007 nt | TSL 1 (best) BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | BACH1-201 | ENST00000286800 | 5669 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |
| CHD4 | Q14839 | ZNF737-201 | ENST00000427401 | 2867 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 7.26 | □□□□□ -1.25 | | |