Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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