Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RN7SKP39-201ENST00000410773 322 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL355472.1-201ENST00000451795 575 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 DACT3-AS1-202ENST00000525008 496 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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