Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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