Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AQP4-AS1-206ENST00000628174 919 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 SMAD5-AS1-201ENST00000297163 1816 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 KLHL8-202ENST00000425278 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 PPFIA2-204ENST00000541017 4192 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 STX2-203ENST00000392373 2151 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 SPINK6-201ENST00000325630 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AL109918.1-202ENST00000406724 436 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 VN2R10P-201ENST00000411871 853 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AC009228.1-203ENST00000430105 432 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AC091132.2-201ENST00000433601 769 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AC012501.2-201ENST00000437634 1281 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 IFNWP5-201ENST00000445100 588 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 LDHAP3-201ENST00000448312 1008 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AL157714.2-204ENST00000452283 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 RPS29P16-201ENST00000452798 171 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AC091951.4-201ENST00000512746 332 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AC069235.1-202ENST00000545535 540 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 ACTN1-AS1-201ENST00000553944 484 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 NUTF2P6-201ENST00000560892 385 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 VWA3A-205ENST00000563755 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 ANP32BP1-201ENST00000564205 1297 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AC022558.2-201ENST00000566841 754 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 CARMN-212ENST00000614896 536 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AC239809.3-218ENST00000616018 1023 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 MED15P6-202ENST00000621415 787 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AL022318.4-202ENST00000622217 591 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AL583852.1-201ENST00000635018 572 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 REG1CP-205ENST00000444841 1710 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NBR1Q14596 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 TRHR-201ENST00000311762 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 TRIM48-201ENST00000417545 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 TNNT3-202ENST00000344578 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NBR1Q14596 TNNT3-205ENST00000381563 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms