Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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