Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms