Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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