Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NPRL3Q12980 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms