Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MYT1L-202ENST00000399161 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 C18orf32-203ENST00000613385 5395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MBTD1-203ENST00000415868 5099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 SLMAP-203ENST00000383718 6749 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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