Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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