Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPTBN1Q01082 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms