Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms