Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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PTPRAP18433 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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PTPRAP18433 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CAST-222ENST00000508579 1758 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC124045.1-201ENST00000606008 1953 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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PTPRAP18433 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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PTPRAP18433 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
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PTPRAP18433 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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