Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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USP18Q9UMW8 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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USP18Q9UMW8 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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USP18Q9UMW8 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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USP18Q9UMW8 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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USP18Q9UMW8 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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