Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CEP44Q9C0F1 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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CEP44Q9C0F1 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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CEP44Q9C0F1 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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CEP44Q9C0F1 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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CEP44Q9C0F1 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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CEP44Q9C0F1 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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CEP44Q9C0F1 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CEP44Q9C0F1 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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