Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms