Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms