Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SYNE4Q8N205 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 517.7 ms