Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC090607.2-201ENST00000560331 695 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MACROD2-202ENST00000378058 4025 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC027319.1-201ENST00000591657 511 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL136146.1-201ENST00000529830 1667 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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