Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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NCOA4Q13772 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 PLP1-220ENST00000612423 3132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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NCOA4Q13772 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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NCOA4Q13772 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 CCL28-201ENST00000361115 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 AL445231.1-201ENST00000445523 1814 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NCOA4Q13772 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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