Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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