Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SP140Q13342 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SP140Q13342 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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