Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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PTP4A2Q12974 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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