Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GTF3C6Q969F1 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms