Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms