Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms