Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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