Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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