Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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SIX1Q15475 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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SIX1Q15475 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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SIX1Q15475 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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SIX1Q15475 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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SIX1Q15475 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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