Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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