Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
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