Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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