Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC00906-202ENST00000587998 648 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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