Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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BNIP1Q12981 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AC069234.3-201ENST00000544939 569 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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BNIP1Q12981 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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BNIP1Q12981 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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BNIP1Q12981 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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BNIP1Q12981 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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BNIP1Q12981 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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BNIP1Q12981 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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