Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ZMYND11-216ENST00000602682 1687 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 FECHP1-201ENST00000431896 1214 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms