Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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