Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NMBRP28336 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NMBRP28336 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NMBRP28336 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NMBRP28336 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NMBRP28336 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NMBRP28336 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NMBRP28336 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NMBRP28336 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NMBRP28336 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NMBRP28336 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NMBRP28336 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NMBRP28336 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms