Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.9 ms