Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms