Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms