Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 OR7A15P-201ENST00000449848 1009 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 IGHVIII-13-1-201ENST00000517613 291 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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FOXQ1Q9C009 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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FOXQ1Q9C009 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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FOXQ1Q9C009 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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FOXQ1Q9C009 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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