Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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ZNF548Q8NEK5 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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ZNF548Q8NEK5 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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ZNF548Q8NEK5 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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