Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1AQ8N9B8 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms